于1994年9月成立。设有系办公室、口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复学及口腔预防医学等四个教研室和口腔医学专业实验室，拥有口腔各专业必备的、先进实验实训设备设施和较完善的现代化教育技术手段。目前，口腔医学系招收学生的层次有全日制口腔医学本科及口腔医学（修复方向）专科，成人教学类型有口腔医学“专升本”及口腔医学专科。

口腔医学系将于近期与佛山市口腔医院实施“院系合一”管理，届时，师资力量较雄厚，高级职称者比例占60%以上，其中主任医师2人，副主任医(技)师及副教授18人，具有博士学位1人，硕士学位9人。

口腔医学系于1984年开设中专教育，是广东省开设口腔教学较早的院校之一，1994年开办口腔医学专科专业，1999年9月开展口腔医学（修复方向）专业教育，成为全省首批举办“新机制、新模式”高职高专教育试点专业。2000年设立口腔专业顾问委员会，聘请中山大学医学院光华口腔医院、广东省口腔医院、佛山市第二人民医院的专家、学者为顾问。口腔修复专业于2000年接受省教育厅的办学水平评估，被确定为我省高职高专教育改革示范试点专业。2001年，口腔修复专业经国家教育部评审，列为全国高职高专教育改革示范试点专业。2005年起，口腔医学本科专业已获准招生。2006年通过教育部组织的复查评估。

    近年来口腔系申报并获批准或以完成的科研课题有省卫生厅项目、佛山市科研项目及佛山市卫生局课题多项，有100多篇论文在各级学术刊物上发表。主持或参编卫生部、教育部规划教材10多部。曾多次主办全国、省、市口腔专业学术会议。